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欧景莉,覃剑峰,余炳宁,黄小江,陆祖双,朱鹏锦,陈豪军.杨桃SCoT标记PCR反应体系建立与验证[J].中国南方果树,2015,44(3):
杨桃SCoT标记PCR反应体系建立与验证
Establishment and verification of SCoT Amplification System for Averrhoa carambola
投稿时间:2015-01-20  修订日期:2015-03-10
DOI:
中文关键词:  杨桃,SCoT,单因素试验,体系优化
英文关键词:Averrhoa carambola  SCoT  Single factor experiment  System optimization
基金项目:农业部农垦局物种资源保护财政专项经费;广西壮族自治区直属公益性科研院所基本科研业务费专项
作者单位E-mail
欧景莉 广西壮族自治区亚热带作物研究所 caoyinglinglan@163.com 
覃剑峰* 广西壮族自治区亚热带作物研究所 597663688@qq.com 
余炳宁 广西壮族自治区亚热带作物研究所 2931608535@qq.com 
黄小江 广西壮族自治区亚热带作物研究所 371771093@qq.com 
陆祖双 广西壮族自治区亚热带作物研究所 372092321@qq.com 
朱鹏锦 广西壮族自治区亚热带作物研究所 329669037@qq.com 
陈豪军 广西壮族自治区亚热带作物研究所 2654958641@qq.com 
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中文摘要:
      用单因素设计法对影响杨桃SCoT-PCR反应体系的主要因素Mg2+, dNTPs,引物, Taq DNA 聚合酶及DNA 模板浓度进行优化。结果表明,适于杨桃研究的SCoT-PCR最佳反应体系为:总体积为20μL的反应体系中,含2.5mmol/L Mg2+,0.3mmol/L dNTPs,30mg/L模板DNA,1.00μmol/L引物和0.4U Taq DNA聚合酶。用不同引物及杨桃DNA对该体系进行验证,扩增条带清晰,结果稳定可靠,证明该反应体系适用于杨桃SCoT-PCR扩增。
英文摘要:
      SCoT-PCR amplification system for Averrhoa carambola was optimized based on single factor experiment design, such as Mg2+, dNTPs, DNA template, Taq DNA polymerase and primer. The results showed that the optimum concentrations for SCoT-PCR amplification system were 2.50 mmol/L Mg2+, 0.3 mmol/L dNTPs, 30 mg/L template DNA, 1.00 μmol/L primer, 0.4 U Taq DNA polymerase, and 2μL 10×buffer in total 20 μL reaction system, respectively. The optimum SCoT-PCR system was tested by different primers and carambola germplasms, obtaining steady, reliable and high resolution bands. It was suggested the reaction system was suitable for the carambola SCoT-PCR amplification.amplification.
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