丁敏,王莹,钟家美,黄爱军.柑橘叶斑驳病毒江西分离物全基因组序列测定与分析[J].中国南方果树,2021,50(3): |
柑橘叶斑驳病毒江西分离物全基因组序列测定与分析 |
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投稿时间:2020-08-16 修订日期:2020-09-06 |
DOI: |
中文关键词: 柑橘叶斑驳病毒 全基因组 系统发育 |
英文关键词: |
基金项目:江西省重点研发计划项目(20161ACF60016);江西省现代农业产业技术体系建设专项资金资助(Jiangxi Agriculture Research System, JXARS-07);赣南师范大学2019年度研究生创新专项资金项目(YCX19A023) |
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中文摘要: |
本研究利用RT-PCR结合RACE技术,从感染柑橘叶斑驳病毒(Citrus leaf blotch virus, CLBV)的叶片中获得了江西分离物CLBV-JX的全基因组序列,并对其序列特征进行分析。CLBV-JX全长8747 nt,编码3个开放阅读框,序列一致性比较结果显示,与来源于柑橘的分离物序列一致度高,均大于95.9%以上,与甜樱桃和猕猴桃来源的分离物序列一致性低,3"端非编码区的核酸一致性仅为62.7%和62.7%。系统进化分析中,CLBV-JX与所有柑橘来源分离物聚为一支,表现出较近的亲缘关系,与其他寄主来源分离物亲缘关系远。推测CLBV的遗传分化可能与寄主存在一定的相关性。 |
英文摘要: |
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