张玉婷,黄昭贤,张景荣,卓明,周良强.不同虫态猕猴桃小蠹虫体内共生细菌多样性分析[J].中国南方果树,2021,50(3): |
不同虫态猕猴桃小蠹虫体内共生细菌多样性分析 |
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投稿时间:2020-11-18 修订日期:2021-03-19 |
DOI: |
中文关键词: 猕猴桃属 壮材小蠹虫 共生细菌 16S rDNA |
英文关键词: |
基金项目:四川省应用基础项目(2018JY0530) |
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中文摘要: |
为了解不同虫态猕猴桃小蠹虫内共生细菌群落组成和结构,本研究利用IonS5TMXL测序平台,对幼虫、蛹、新成虫和老成虫4种虫态小蠹虫体内细菌的16S rDNA-V4区进行高通量测序;利用Uparse软件对有效数据进行操作分类单元聚类,用Mothur法和SSUrRNA数据库注释OTUs序列,分析样本的群落组成;使用Qiime软件计算Shannon,ACE等多样性指数。结果表明,以相似度97%为标准进行聚类,得到808个OTUs,注释到14个门,26个纲,48个目,76个科,133个属。各虫态的菌群组成和菌落多样性存在较大差异,但均以变形菌门为其优势菌门,其丰度高达62.97%-98.21%。幼虫和新成虫的细菌群落多样性较低,而蛹和老成虫的则较高。在幼虫和蛹中,未鉴定到属水平的菌群所占比例较高,分别占菌群总数的68.0%与46.3%,立克次体属(Rickettsia)的丰度在两个虫态菌群中分别占17.83%和8.49%;而上述立克次体属在成虫中占绝对优势,其丰度在新成虫和老成虫中分别高达41.38%与48.71%。研究结果可为基于共生关系的猕猴桃小蠹虫的生物防控技术的开发提供信息。 |
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